「Summary」ヒトの呼吸器，特に肺の生理機能や病態の分子機構をタンパク質を網羅的に解析する手法に，質量分析によるプロテオミクス研究がある。本稿では，質量分析プロテオミクスの概要とその最近の進歩を紹介した。質量分析プロテオミクスにより，肺や肺癌組織，肺の培養細胞などのタンパク質が網羅的に同定・定量されるが，同時に，抗体プロテオミクスによるタンパク質の空間・位置情報の必要性を述べた。また，プロテオミクスによる肺癌や他の肺疾患のバイオマーカー探索の現状を文献的に紹介した。