血管細胞クロマチン構造の網羅解析

「Summary」近年, 遺伝子発現におけるエピゲノム情報の意義が明らかになり, ゲノム上にある転写制御因子は一般的にゲノム塩基配列を大きく隔てて働くことが知られるようになった. この時の相互作用を評価するため, 2002年にはゲノム上の2点間の三次元的な近接関係を定量する3C(chromosome conformation capture)アッセイが考案された. また, 2009年には3Cアッセイを改良・発展させ, 網羅的にクロマチン立体構造を評価できるChIA-PET(chromatin interaction analysis with pairedend tag seguencing)が開発, 報告された. われわれは, これらの手法を用いて, 血管細胞におけるクロマチン立体構造変化を介した新しい遺伝子発現調節のメカニズムを見出してきたので, その知見を例示しながら, これらの手法について概説する.

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