次世代シーケンシング（Next-Generation Sequencing：NGS）による技術革新は目覚ましく，その網羅性を活用した病原体検出法に期待が高まっている．NGS検査法は検体DNA/RNAをまるごと解読して配列同定するメタゲノム解析法であり，“制限のないマルチプレックス定量PCR検査”と同等かつ網羅的に病原体を検出する核酸診断法である．NGS検査法は煩雑なプライマー設計やPCR反応条件などの最適化が全く不要であり，多様な臨床検体への検査応用がなされている．NGS技術のさらなる発展が期待され，感染症診断や公衆衛生学的病原体検索アプローチにパラダイムシフトを生じさせる可能性をもっている．
「KEY WORDS」Next-Generation Sequencing（NGS），網羅的病原体検出法，メタゲノム，RNA-seq