新型コロナウイルス感染症は短期間で多くの変異株が流行した．主要な臨床症状はすべての株で共通するが，それぞれの株での特徴は確認されている．その予後は，ワクチンや既感染，診断法や治療法に大きく影響される．日本における新型コロナウイルス感染症の流行株の変遷および臨床像は，ウイルスの遺伝子的特性，公衆衛生対策，治療法およびワクチン開発とその効果，そして国内外の流行状況に密接に関連していることから，流行株の監視と科学的な理解の進展は，パンデミックの管理と今後の流行への対策に不可欠である．