ヒトの身体にはさまざまな常在細菌が定着しており，その種類は約1,000種類，個体数にすると100兆以上といわれている^１）。特に，消化管は最も多種多様な細菌叢を形成し，宿主であるヒトの数十倍にも及ぶ遺伝子を有する。しかしながら，腸内細菌叢は培養困難な細菌が多く，従来の培養法を基にした解析手法では，腸内細菌叢全体を網羅し解釈することが困難であった。近年，次世代シーケンサーの開発，普及とともに，培養法によらない腸内細菌叢の解析方法が飛躍的に進歩し，さまざまな疾病の発症に腸内細菌叢が関与することが示唆され，健康維持，発症予防，疾病の治療における腸内細菌叢の重要性に注目が集まっている。本稿では，出生から小児に至る腸内細菌叢の変化と，その後の小児疾患について概説する。
「KEY WORDS」腸内細菌叢，疾病，小児，腸管免疫，dysbiosis