新型コロナウイルス感染症（coronavirus disease-2019：COVID-19）がパンデミックを引き起こしてから，約3年半が経過した．2023年6月現在，本疾患はエンデミック（地域流行）に近づいてはいるものの，依然として，公衆衛生学的に感染・超過死亡の拡大も含め，予断を許さない状態となっている^1,2）．

世界各地に拡散した新型コロナウイルス（severe acute respiratory syndrome coronavirus type 2：SARS-CoV-2）は，プロトタイプの武漢株を始祖ウイルスとした数多くの変異型（variant）ならびに亜変異型（subvariant）が2020年以降，出現し続けている^3）．この進化のプロセスで，当該ウイルスの主要抗原であるS（spike）蛋白のアミノ酸置換は，特にウイルス受容体（angiotensin converting enzyme 2 receptor：ACE-2R）との結合部位と推定されるレセプター結合領域（receptor binding domain：RBD）を中心に生じている^3）．また，2022年以降，世界各国で主流行型となっているオミクロン変異型（omicron variant）は，さらにその派生型である亜変異型を数多く生み出し，世界各国で本疾患流行の主流となっている^1-4）．このような背景から，本稿においては，オミクロン変異型・亜変異型を中心とした当該ウイルスS蛋白の分子進化を中心とした最新知見について概説する．