HIV感染症における肛門がんの発生率は非HIV感染者と比較して有意に高く，とくに男性同性間性的接触者（men who have sex with men；MSM）で問題となる。肛門がんは，主に肛門への高リスク型ヒトパピローマウイルス（human papillomavirus；HPV）の感染が契機となるが，女性の子宮頸がんのスクリーニングと異なり，HPV既感染のMSMにおける肛門がんのスクリーニング法・予防法として，拡大肛門鏡および焼灼術が海外の一部で実施されているものの，標準予防法は確立していない。また，HPV関連の咽頭がんは，肛門がんと比較しても，スクリーニング法確立の目途は全く立っていない。咽頭がんは早期の診断が難しく，死亡率は高く，生命予後も著しく改善しているものの喫煙者の割合が多いHIV感染者において今後の重要な課題となる。