多発性硬化症（multiple sclerosis：MS）では，診断に加え，再発や進行を判断する確実なマーカーが存在しないことが，臨床上の課題となっている。IgGインデックスやオリゴクローナルバンドは古くから，中枢神経炎症を反映する髄液マーカーとして使われてきた。ニューロフィラメントやGFAPは髄液・血液マーカーとして，重症度や疾患進行の予測因子となりうる可能性がある。また，マイクロRNAもMS病態を反映するマーカーとしての期待が高まっている。さらに，Nogo受容体アンタゴニストのLOTUSは，再発や進行を反映するマーカーとして有望である。しかし，これらのいずれもが感度，特異度の点で確実なマーカーとはいえず，さらなるマーカー開発が望まれる。